From: Umut D. (linuxlist@gmail.com)
Date: Sat 27 Aug 2005 - 18:50:46 EEST
Bence burada "6" bit'in muhabbetini yapmayalim :P
Şaka bir yana, bence gercekten %75 yer kazanciniz olacak, 8 bit yerine 2
bit.
Ancak o 2 bitlik veriyi analiz etmek icin gereken en basit matematiksel
fonksiyonlari
bile oturup 2 bite uyacak sekilde yazmaniz gerekecek. Ya da veritabanindan
cektikten sonra yine char olarak kullanacaksiniz vs...
Tamsayi ya da 8 bitlik veri dizeleri uzerinde calisan zaten pek cok
istatistik vs
kutuphanesi bulmaniz mumkun.
Eski bir tabirle "Attiginiz tas urkuttugunuz kurbagaya degmez"
Tabi data miktari buyudukce donanimda daha fazla disk ve ram gerekecek...
Secim sizin...
On 8/27/05, serdar güler <e141598@metu.edu.tr> wrote:
>
> Herkese iyi günler,
>
> Biyoteknoloji ile ilgili bir tez çalışmam var, genome database şeklinde
> bir uygulama yazmak gibi bir düşüncemiz var.
>
> Genetiğe uzak olanlar için küçük bir için bilgi vereyim. DNA'yı
> oluşturan sadece 4 farklı çeşit baz var (adenin (A), timin(T), guanin(G)
> ve cytosine (C)).
>
> başka yazılmış databaseleri biraz inceledim, anladığım kadarıyla bu
> veriler -en azından benim gördüklerimde- karakter değişkenler olarak
> tanımlanmış ama aslen 2 bitlik değişkenler ile tanımlanıp bir hayli yer
> kazanımı olabilir gibi geldi. Bu mümkün müdür? tabii mesela insanın
> genomunda 10^7-10^8 arası baz olduğunu da eklersek ne kadar yer kazanımı
> olacağı konusunda bir fikir edinebilirsiniz sanırım.
>
> neyse programlama ile meslek olarak uğraşan insanlardan da tavsiye almak
> istedim sadece. Mesela ben şöyle bir şey yapmak istesem elimdeki 1000
> bazlık bir DNA dizisinin elimdeki hedef 10^7 lik DNA dizisindeki
> herhangi bir bölge ile % kaç benzerlik içerdiğini ya da en fazla hangi
> bölgeyle benzerlik içerdiğini anlamak için fonksiyonlar yazsam bu 2
> bitlik tanımlama hikayesi benim hızımı ne kadar arttırır. Sonuç olarak
> uğraşmaya değer mi?
>
>
> _______________________________________________
> Linux-programlama mailing list
> Linux-programlama@liste.linux.org.tr
> http://liste.linux.org.tr/mailman/listinfo/linux-programlama
>
>
>
_______________________________________________
Linux-programlama mailing list
Linux-programlama@liste.linux.org.tr
http://liste.linux.org.tr/mailman/listinfo/linux-programlama